木瓜酶，是一种有机化合物，分子式C9H14N4O3。 是利用未成熟的番木瓜果（Carica papaya）表皮的白色乳汁，采用现代生物工程技术提炼而成的纯天然生物酶。
它是一种含巯基(-SH)肽链内切酶，具有蛋白酶和酯酶的活性，有较广泛的特异性，对动植物蛋白、多肽、酯、酰胺等有较强的水解能力，同时，还具有合成功能，能把蛋白水解物合成为类蛋白质。
低生产成本。
行业应用
医药工业应用
含有木瓜酶的药物，能起到抗癌、肿瘤、淋巴性白血病、原菌和寄生虫 、结核杆菌等，可消炎、利胆、止痛、助消化。治疗妇科病、青光眼、骨质增生、枪刀伤口愈合、血型鉴别、昆虫叮咬等。
食品工业应用
可利用酶促反应，使食品大分子的蛋白质水解成小分子肽或氨基酸。用于水解动植物蛋白、制成嫩肉粉、水解羊胎素、水解大豆、饼干松化剂、面条稳定剂、啤酒饮料澄清剂、高级口服液、保健食品、酱油酿造及酒类发酵剂等。有效转化蛋白质的利用，大大提高食品营养价值，降低成本。有利于人体的消化和吸收。
用作嫩 肉素
肉类可借加入水解蛋白酶 , 合剂而得到嫩化 。如木瓜酶 , 无花果蛋白酶、 菠萝蛋 白酶 , 胰蛋 白酶或它们的把酶注射到 肉中或在屠杀前注射到活动物的血液循环系统中, 后 者对于处理大批量的牲 畜最为有效。 它使酶分布于动物全身的血管中 , 为肌 肉和其他组织提供足够量 的酶 , 因 而经此处理的肉在烹调时变得更松软。
用作啤酒澄清剂
作此处理 的嫩化 肉能 以较 高的价钱出售。储存啤酒 在低温下 会产生 蛋白一聚 酚沉淀。水解蛋 白酶可使蛋 白质部分降解 , 使之不发 生沉淀。 同时木瓜酶有催化类蛋 白形 成并产生凝乳作用浊的原因 。
美容化妆品应用
将木瓜酶加入到含有蛋白质和油脂的化妆品中，具有独特的美白嫩肤、美颜保健、袪斑除污垢、促进血液循环、改善肌肤等功效，提高产品档次。可制成减肥茶、美容护肤品等。
日化品工业应用
用于香皂、肥皂、洗涤剂、洗衣粉、洗手液等，去污力强，除菌消毒、安全放心。
饲料工业应用
用于饲料添加剂，开发蛋白源，利于吸收，提高饲料的利用率，节约成本，有助于牲畜消化，加速生长。如在猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅、鱼、虾等饲料中添加。还可以作为蔬菜水果高级复合肥料的添加剂。
皮革工业应用
利用木瓜酶制成脱毛剂，鞣制皮革，具有毛孔细腻，皮纹光亮效果。
纺织工业应用
可用于处理羊毛、蚕蛹脱胶、蚕丝精炼，能达到手感柔软、舒适、抗收缩、抗张强度等效果。
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