一种重要的医药中间体，也是PC 阻燃剂的原料。用于合成氟碳表面活性剂、含氟农药、染料、聚碳酸酯加工处理分散剂等用途抗菌增效剂，与磺胺类药合用增强抗菌效果，也用于禽球虫感染、肠道细菌感染；口服用途可以用来合成多种含氟特种表面活性剂。其钾盐全氟丁基磺酸钾是一种优良的阴离子表面活性剂，又是聚碳酸酯阻燃剂。全氟丁基磺酰氟是一种全氟化物，常温下为液体，主要用于合成氟碳表面活性剂、含氟农药、染料、聚碳酸酯加工处理分散剂等。
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