1032678-42-4
中文名称
CY5 琥珀酰亚胺酯
英文名称
Cyanine5 NHS ester
CAS
1032678-42-4
分子式
C36H42ClN3O4
分子量
616.2
MOL 文件
1032678-42-4.mol
更新日期
2025/08/01 19:26:43
1032678-42-4 结构式
基本信息
中文别名
CY5 琥珀酰亚胺酯 英文别名
Cyanine5 NHS ester chloride2-[5-(1,3,3-trimethyl-2,3-dihydro-1H-indol-2-ylidene)-1,3-pentadienyl]-3,3-dimethyl-1-[5-(succinimidooxycarbonyl)pentyl]-3H-indolium chloride
1-(8-((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-8-oxooctyl)-3,3-dimethyl-2-((1E,3E,5Z)-5-(1,3,3-trimethylindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium chloride
所属类别
化学试剂：酰亚胺物理化学性质
外观性状外观 : 深蓝色固体
ex/em : 640/664nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 250000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.2
ex/em : 640/664nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 250000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.2
溶解度易溶于DMF等有机溶剂
外观Dark blue solid
ε(消光系数)250000 L⋅mol−1⋅cm−1
Φ(量子产率)0.2
激发峰(Ex)/发射峰(Em)640/664nm (PBS buffer)
InChIKeyWYDRTLYIBJFWFL-UHFFFAOYSA-M
SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC=CC=C12)C=CC=CC=C1C(C2=CC=CC=C2N1C)(C)C)CCCCC(=O)ON1C(CCC1=O)=O.[Cl-]
常见问题列表
荧光标记染料
Cy5 (Cyanine 5) 是一种发远红(far-red)荧光的花青素荧光染料。它的消光系数很高，荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 Cy5或APC滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。Cy5荧光落在远红光区，使用Cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域CCD相机/检测器检测灵敏度最高。Cy5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，纳米粒等，它最用于是标记核酸分子（DNA和RNA）。NHS活化酯（N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester（NHS），succinimidyl ester（SE））是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy5分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（主要伯胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把Cy5分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），Cy5-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和Cy5-NHS反应。
注意事项
- NHS ester基团对湿度比较敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需室温放置回温至少20分钟。
- 使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液（PBS）；Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂白。
- Cy5荧光处于红光区，尽管仪器检测最灵敏，但是人肉眼对此区红光不敏感，除非很强，Cy5荧光在显微镜下肉眼难观察到。
生物活性
Cyanine5 NHS ester chloride 是一种红色荧光染料，用于标记肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。体外研究
Cyanine-5 NHS ester amine-reactive red emitting fluorescent dye is used to react with the free amino group on the cysteine amino acid present in terminal peptides used for end-capping Poly(β-amino esters) (pBAEs) backbones.