1593644-29-1

中文名称 CY3,马来酰亚胺

英文名称 3H-Indolium, 1-[6-[[2-(2,5-dihydro-2,5-dioxo-1H-pyrrol-1-yl)ethyl]amino]-6-oxohexyl]-2-[3-(1,3-dihydro-1,3,3-trimethyl-2H-indol-2-ylidene)-1-propen-1-yl]-3,3-dimethyl-

CAS 1593644-29-1

分子式 C36H43N4O3+

分子量 579.76

MOL 文件 1593644-29-1.mol

更新日期 2025/11/18 14:26:22

1593644-29-1 结构式

基本信息物理化学性质应用领域常见问题列表

基本信息

中文别名

CY3-马来酷亚朋
脂溶CY3马来酰亚胺
菁染料CY3马来酰亚胺
CYANINE3-MAL
花氰染料CY3-马来酰亚胺

英文别名

3H-Indolium, 1-[6-[[2-(2,5-dihydro-2,5-dioxo-1H-pyrrol-1-yl)ethyl]amino]-6-oxohexyl]-2-[3-(1,3-dihydro-1,3,3-trimethyl-2H-indol-2-ylidene)-1-propen-1-yl]-3,3-dimethyl-

所属类别

染料及颜料：染料

物理化学性质

外观性状外观 : 红色粉末
ex/em : 554/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 150000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.31

溶解度可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有机溶剂，难溶于水

外观Red powder

ε(消光系数)150000 L⋅mol−1⋅cm−1

Φ(量子产率)0.31

激发峰(Ex)/发射峰(Em)554/566 nm (PBS buffer)

InChIKeyVGIOMTUJDCDPEN-UHFFFAOYSA-O

SMILESC([N+]1=C(C(C)(C)C2=CC=CC=C12)C=CC=C1C(C2=CC=CC=C2N1C)(C)C)CCCCC(=O)NCCN1C(C=CC1=O)=O

应用领域

用途一

Thiol mono-reactive Cyanine3 dye. This reagent can be used to attach Cyanine3 fluorophore (an analog of Cy3?) to proteins and peptides containing cysteine residues, as well as to other thiolated molecules (such as thiol-containing oligonucleotides)._x000D_ _x000D_ Cystines should be reduced with TCEP (tris-carboxyethylphosphine) or other appropriate reductant prior to the labeling._x000D_ _x000D_ Labeling with Cyanine3 maleimide is selective, and efficient._x000D_ _x000D_ We recommend using water-soluble Sulfo-Cyanine3 maleimide for the labeling of antibodies and other sensitive proteins.

常见问题列表

荧光标记染料

Cy3 (Cyanine 3) 是一种发橘黄色荧光的花青素荧光染料。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，Cy3的背景荧光一般认为比TAMRA等TRITC系列的染料低。 Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
马来酰亚胺(maleimide)是生物标记反应中常用的基团，它可以和巯基(-SH)通过亲和加成反应生成稳定的巯醚(thioester)结构从而实现标记。尽管胺基(比如赖氨酸精氨酸侧链)也有亲和性，但在中性或微酸性缓冲液中，马来酰亚胺选择性标记巯基(反应速度比胺基快>1000倍)。标记反应反应迅速，选择性高，产率好，另外，巯基是一种在生物分子中广泛存在的官能团，比如蛋白中的半胱氨酸(cysteine)和双硫键等，因此马来酰亚胺/巯基(maleimide/thiol)标记已成为仅次于NHS/胺基标记的最常用生物连接反应(bioconjugation)。
Cy3-马来酰亚胺的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即磺化Cy3-马来酰亚胺。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
Cy3-马来酰亚胺标记后的产物Ex/Em是554/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。

注意事项

Cy3-马来酰亚胺水溶性较低，标记反应可在纯有机溶剂中进行或者含有机助溶剂的水相中进行。
天然生物分子中巯基一般于氧化状态(如双硫键)存在，在马来酰亚胺标记前，务必用还原剂(如DTT，TCEP)活化巯基并除去多余还原剂。
马来酰亚胺也可以和叠氮化合物反应，应避免叠氮官能团。
标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。