2055138-89-9

中文名称水溶cy5.5-N3

英文名称 diSulfo-Cy5 azide

CAS 2055138-89-9

分子式 C33H43N6NaO7S2

分子量 722.85

MOL 文件 2055138-89-9.mol

更新日期 2025/07/30 15:03:52

2055138-89-9 结构式

基本信息物理化学性质常见问题列表

基本信息

中文别名

磺化CY3-叠氮
水溶CY3-N3
水溶CY5.5-N3
二磺酸-CY3-叠氮
三磺酸基CY5.5叠氮
三磺酸-CY5.5-叠氮
二磺酸基-CY3叠氮(甲基)
水溶性DISULFO-CY3 AZIDE/N3/叠氮(METHYL)

英文别名

Sulfo Cy5.5 N3
diSulfo-Cy5 azide
diSulfo-Cy3 azide/N3
triSulfo-Cy5.5 azide

所属类别

化学试剂：有机试剂

物理化学性质

外观性状外观 : 红色粉末
ex/em : 550/566 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε) : 162000 L⋅mol−1⋅cm−1
量子产率(Φ) : 0.1

溶解度Soluble in Water, DMSO, DMF, DCM

外观Red powder

ε(消光系数)162000 L⋅mol−1⋅cm−1

Φ(量子产率)0.1

激发峰(Ex)/发射峰(Em)550/566 nm (PBS buffer)

常见问题列表

概述

水溶cy5.5-N3 是一种水溶性的叠氮青色素染料和荧光探针 (Ex/Em=548/563 nm)。Sulfo-cyanine3 azide sodium 可参与融合三环杂环的合成，制备免疫刺激剂。它含有 Azide 基团，可以和含有 Alkyne 基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应（CuAAc)。它还可以和含有 DBCO 或 BCN 基团的分子发生环张力促进的炔-叠氮环加成反应 (SPAAC)。

荧光标记染料

磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。磺化Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸等各种生物分子。
磺化Cy3水溶性非常好，可在水相标记反应体系中直接使用，不需要有机溶剂助溶，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外由于强水溶性加染料分子本身带电荷，磺化Cy3标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。
叠氮(azide)是常用生物标记基团。通过点击化学反应(click chemistry)，叠氮可以和一系列炔烃(alkyne)或环炔烃(strained alkyne)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速定量完成(几乎100%产率)，即使在低浓度(μM)和低温(4oC)下也可完成。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用广泛。
磺化Cy3标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。

注意事项

磺化Cy3水溶性高，极性强，如需脂溶性标记染料，请选择普通Cy3-叠氮。
叠氮化合物可被强还原剂(如DTT)还原破坏，使用时务必去除还原剂。
标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)。