甲氧基聚乙二醇胺是一类重要的修饰性聚乙二醇，修饰性PEG又叫修饰性聚乙二醇，是经过化学修饰基团或者生物活性基团修饰的PEG。
甲氧基聚乙二醇胺有以下应用：1.军工传感器用耐腐蚀涂层材料；2.聚乙二醇为载体的冬凌草甲素的前药。
1.甲氧基聚乙二醇胺2000的制备
将2g单甲氧基聚乙二醇叠氮2000溶于20mL干燥的四氢呋喃中，后加入10％钯碳0.2g，反应瓶中空气置换为氢气，25℃反应24小时，反应完全。抽滤去除钯碳，减压蒸干溶剂，无水乙醚打浆进行提纯，得1.8g产品，收率为90.14％。
2.甲氧基聚乙二醇叠氮1000的制备
在氮气的保护下，将1.0g的单甲氧基聚乙二醇1000、0.53g三苯基磷。0.56g叠氮磷酸二苯酯溶于10mL的干燥的二氯甲烷中，将反应瓶放置在0℃的低温环境中搅拌一定时间待反应瓶内的温度低于5℃，然后缓慢滴加偶氮二甲酸二异丙酯0.4g，在滴加过程中保持温度处于15℃以下。滴加完毕后反应体系逐渐由混浊变澄清，颜色由淡黄色变为金黄色。反应3小时后反应完全，减压蒸干容积，得黄色油状物，通过无水乙醚打浆纯化，得产物0.86g收率为83.25％。
甲氧基聚乙二醇胺可作为PEG修饰剂，属可溶性的多聚体，用于支撑多肽合成；制备各种含聚乙二醇的结合物。