黄素腺嘌呤二核苷酸二钠是一种酶促氧化还原辅因子。可用作黄素蛋白的氧化还原辅因子(电子载体),黄素蛋白包括琥珀酸脱氢酶(复合物)、α-酮戊二酸脱氢酶、凋亡诱导因子2(AIF-M2,AMID)、叶酸/FAD依赖性tRNA甲基转移酶和N-羟基化黄素蛋白单加氧酶。FAD是丙酮酸脱氢酶复合物的组分。
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