我们的实验室服务包括单细胞转录组测序、单细胞蛋白检测及单细胞免疫组库。针对不同的实验需求,单细胞测序相关技术可以应用于不同的场景。
scRNA-seq利用磁珠+寡核苷酸的偶联结构,寡核苷酸的结构分为4个组成部分:PCR引物结合位点、细胞条形码、分子标签和poly-dT序列。通过A-T互补配对的方式,捕获并标记单个细胞释放出的带有polyA尾巴的mRNA分子,最终利用高通量测序反映每个细胞的各个基因的mRNA含量。
在单细胞水平,将蛋白组学和转录组学的检测相结合,进行多维度的单细胞信息解读。不仅可以更好地揭示细胞之间的异质性,同时也能更清晰地辨别特定细胞及其功能。BD Abseq与BD Rhapsody高通量单细胞捕获系统结合使用的方法,能够使样机组合同时分析成千上万单细胞中的RNA和蛋白质,研究复杂的多细胞系统和生物学过程。
AbSeq是利用特异性抗体+寡核苷酸的偶联结构,将蛋白表达量转化为特异性抗体携带的核酸条形码的分子数,最终利用高通量测序手段反映单细胞水平的蛋白表达量。
免疫组库(immune repertoire,IR) 是指在任何指定时间,生物个体的免疫系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。这种免疫组库的多样性,具体体现在由V、D、J、C基因区段排列组合形成的B细胞受体(BCR)或T细胞受体(TCR)的多样性上。单细胞免疫组库测序技术(scVDJ-seq),可以在单细胞水平,通过一次实验同时测定成千上万个淋巴细胞克隆的天然VDJ序列及其组合信息。这种单细胞精度、高通量的免疫组库研究方法,极大的提高了相关研究的效率。
如下所示:聚类分群及mark基因在不同分群中的表达图
更多示例请查看:技术平台 -> 生物信息学 -> 单细胞测序分析模块
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Single-cell transcriptomic atlas of the human endometrium during the menstrual cycle
Wanxin Wang #, Felipe Vilella #, Pilar Alama, Inmaculada Moreno, Marco Mignardi, Alina Isakova, Wenying Pan, Carlos Simon, Stephen R Quake
Nat Med (IF:87.241) 26(10):1644-1653. doi: 10.1038/s41591-020-1040-z.
Tracing haematopoietic stem cell formation at single-cell resolution
Fan Zhou, Xianlong Li, Weili Wang, Ping Zhu, Jie Zhou, Wenyan He, Meng Ding, Fuyin Xiong, Xiaona Zheng, Zhuan Li, Yanli Ni, Xiaohuan Mu, Lu Wen, Tao Cheng, Yu Lan, Weiping Yuan, Fuchou Tang, Bing Liu
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Generation and Application of Mouse-Rat Allodiploid Embryonic Stem Cells
Xin Li, Xiao-Long Cui, Jia-Qiang Wang, Yu-Kai Wang, Yu-Fei Li, Le-Yun Wang, Hai-Feng Wan, Tian-Da Li, Gui-Hai Feng, Ling Shuai, Zhi-Kun Li, Qi Gu, Jie Hao, Liu Wang, Xiao-Yang Zhao, Zhong-Hua Liu, Xiu-Jie Wang, Wei Li, Qi Zhou
Cell (IF:66.85) 164(1-2):279-292. doi: 10.1016/j.cell.2015.11.035.
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