Allyl Fluorescent dNTPs

Name：3′-O-allyl-dUTP-allyl-R6G

Formula: C₄₈H₅₁N₆O₂₀P₃

Molecular Weight: 1128.91

Purity:≥ 99.9 % (HPLC)

Spectroscopic Properties: (λabs (max)=525 nm; λem (max)=550 nm),

Name：3′-O-allyl-dCTP-allyl-bodipy-FL-510

Formula: C₃₅H₄₅BF₂N₇O₁₆P₃

Molecular Weight: 961.51

Purity: ≥ 99.9 % (HPLC)

Spectroscopic Properties: (λabs (max)= 502 nm; λem (max)= 510 nm),

Name：3′-O-allyl-dATP-allyl-ROX

Formula: C₅₇H₆₃N₈O₁₇P₃

Molecular Weight: 1225.09

Purity: ≥ 99.9 % (HPLC)

Spectroscopic Properties: (λabs (max)= 585 nm; λem (max)= 602nm),

Name：3′-O-allyl-dGTP-allyl-bodipy-65

Formula: C₄₆H₄₈BF₂N₈O₁₇P₃S

Molecular Weight: 1158.72

Purity: ≥ 99.9% (HPLC)

Spectroscopic Properties: (λabs (max)=630 nm; λem (max)=650 nm),

Solexa的测序原理是可逆终止化学反应。DNA片段加上接头之后，可以随机的附着于玻璃表面（Flow cell），并且在固相的表面经过桥式扩增。这样就形成了数千份相同的单分子簇，被用做测序模板。测序采取边合成边测序的方法，和模板配对的ddNTP原料被添加上去，不配对的ddNTP原料被洗去，成像系统能够捕捉荧光标记的核苷酸。随着DNA 3'端的阻断剂的去除，下一轮的延伸就可以进行。和焦磷酸测序不同，每次DNA的只能延伸一个核苷酸。Solexa的读长在100-150bp之间，适合小RNA鉴定、甲基化和表观遗传学研究。