精准构建修饰型寡核苷酸骨架
该化合物是胞苷的衍生物,属于核苷亚磷酰胺类核心砌块,而核苷亚磷酰胺是固相合成寡核苷酸的标准原料。其分子结构中的 3'- 氰乙氧基亚磷酰胺基团可在 1H - 四唑等催化剂作用下,与另一个核苷单体的 5'- 羟基发生偶联反应,实现核苷酸链的逐步延伸。同时,它能精准将 5 - 甲基胞苷结构引入寡核苷酸序列,这种修饰可改变寡核苷酸与靶标核酸的结合特性,为后续功能调控奠定基础。
赋予寡核苷酸核酸酶抗性,延长作用周期
分子中含有的 2'-O - 甲氧乙基(即 2'-O-MOE)修饰是核心功能修饰之一。天然寡核苷酸进入细胞后易被核酸外切酶和内切酶降解,而 2'-O - 甲氧乙基修饰能显著提升合成寡核苷酸的抗降解能力,其稳定性介于未修饰核苷和硫代磷酸化修饰核苷之间。这种特性可延长寡核苷酸在体内的半衰期,确保其能持续发挥靶向作用,这对 antisense 药物、siRNA 等需在体内长期起效的核酸药物而言至关重要。
保障合成过程的特异性与产物纯度
它的结构中包含多个保护基团,可避免合成中不必要的副反应:一是 5'-O-DMT(二甲氧基三苯甲基)基团,能特异性保护 5'- 羟基,防止该位点提前参与偶联反应,且该基团易通过酸性条件脱保护,不影响后续链延伸;二是 N4 - 苯甲酰基可保护胞苷上的氨基,避免氨基与亚磷酰胺基团等发生副反应。这些保护基团的存在能大幅减少合成中的杂质,保障最终寡核苷酸产物的纯度。
支撑多种核酸相关的研究与应用
由该单体合成的含 2'-O - 甲氧乙基和 5 - 甲基胞苷的寡核苷酸,有多样的应用场景。例如在基因调控研究中,可作为 siRNA 或反义寡核苷酸的关键组成部分,通过阻断 mRNA 翻译等机制抑制目标基因表达;在核酸探针或适配体研发中,其修饰后的结构能提升探针与靶标(如特定 mRNA、蛋白质)的结合亲和力和稳定性,优化检测或靶向结合效果;此外,这类修饰型寡核苷酸还可用于三链形成寡核苷酸的研发,助力基因靶向编辑等前沿研究。
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