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醋酸氯己定为阳离子表面活性剂，抗菌谱广，对多数革兰阳性及阴性细菌都有杀灭作用，对绿脓杆菌也有效。用于手术前手、皮肤、创面及器械消毒。本品抗菌谱广，对氯脓杆菌也有效，其抗菌作用强，而且 毒性低。 醋酸氯己定为双胍类化合物，通过改变细菌胞浆膜的通透性使细胞内容物漏出，而起到杀菌作用。 部分葡萄球菌属、变异链球菌、唾液链球菌、大肠埃希菌、丙酸杆菌和白念珠菌对本品敏感；嗜血链球菌呈中度敏感；对变形杆菌属、假单胞菌属、克雷伯菌属和革兰阴性球菌等作用微弱。醋酸氯己定因带阳电荷，吸附在细菌胞浆膜的渗透屏障，使细胞内容物漏出，低浓度呈抑菌作用，高浓度时呈杀菌作用。
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