技术原理
m6A-miCLIP是一种结合交联免疫沉淀与高通量测序的技术,旨在高分辨率定位RNA分子上的m6A(N6-甲基腺苷)修饰位点。m6A是RNA表观遗传修饰的核心类型,参与调控RNA代谢、翻译和稳定性,与癌症、神经疾病等密切相关。
m6A-miCLIP通过紫外或化学剂交联RNA与m6A抗体,经RNA酶去除非甲基化的片段,进一步通过文库构建与测序获取修饰位点信息。
技术应用
(1)全转录组m6A修饰定位研究
(2)动态修饰调控研究
(3)甲基化差异基因分析
(4)RNA甲基化模式序列分析
技术特点
与m6A-RIP/meRIP-Seq相比,miCLIP可提供更高的分辨率,而meRIP更适合做全局粗定位与差异峰分析。
产品优势
(1)包含文库构建模块:试剂盒内含构建测序文库试剂,产物可以用于高通量测序。
(2)高分辨率:与meRIP实验相比,m6A-miCLIP经过了RNA的片段化,分辨率能达到40~100nt的范围。
(3)提供序列特异性信息:m6A-miCLIP不仅能定位修饰位点,还能揭示m6A修饰的序列偏好。
(4)产物测序低背景噪音:交联能维持m6A抗体与m6A RNA的直接接触,片段打断与抗体富集能减少非特异性结合的背景噪声。
(5)组分完备、实验流程短:试剂盒内含有m6A抗体、小RNA提取试剂、建库试剂,完成产物建库仅需5h。
壹迈(广州)生物医学科技有限公司
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申小青