二甲基亚砜是许多化学反应的常用溶剂,被广泛的应用于有机合成及工业应用(聚合物化学、制药及农业化学品)。除此以外，在有机合成中，二甲基亚砜亦可用用于许多氧化反应中。同时二甲基亚砜越来越广的用于与微电子工业的生产制造,例如平板显示器制造的光阻剥离剂。在医药上，二甲基亚砜最主要利用于局部止痛剂、局部药物载体、消炎药与抗氧化剂。由于二甲基亚砜能够提高药物在包括皮肤在内的机体有机组织中的吸收率，它可以用来作为许多药物的载体。因为拥有极强的有机化合物溶解能力，所以在药物样本管理和高速药物筛选中起着重要作用。 在生物学上二甲基亚砜也可作为冷冻保护剂的使用，增加细胞基质，以防止在冷冻过程中细胞死亡
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