ChIP-Seq

染色质免疫共沉淀（ChIP）是在体内环境中研究蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法，广泛应用于组蛋白修饰、特定转录因子的基因调控作用等相关领域。随着新一代测序技术的发展和成熟，染色质免疫沉淀实验与高通量测序的整合——Chromatin Immunoprecipitation Sequencing （ChIP Sequencing ），可在全基因组范围对蛋白结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定，同时也为研究的深入开展打下基础。
       采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后，分离与其结合的基因组DNA片段，再通过高通量测序与数据分析，在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，并且可以基于多个样品进行差异比较。

技术优势:

• 检测范围广：全基因组范围的免疫沉淀与测序分析；
• 高性价比：基于抗体富集目标区域，有效降低测序数据量；
• 微量样本：只需10 ng以上免疫沉淀后的DNA，即可进行测序分析。

研究内容:
一、标准信息分析 
1)         去接头污染，去低质量reads和产量情况统计；
2)         ChIP 测序序列与参考基因组序列的比对；
3)         ChIP 测序Reads 在全基因组的分布；
4)         统计ChIP测序数据富集区域( Peak ) 的信息；
5)         Peak相关基因筛选与GO功能聚类分析；
6)         多个样品的差异分析；
7)         UCSC Genome Browser使用说明；
二、高级信息分析
 不同表达水平的基因在TSS附近区域的reads 富集程度。
三、定制化信息分析
可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容。