背景[1-3]
NHP2核糖核蛋白抗体是可以特异性结合NHP2核糖核蛋白的一类多克隆抗体，主要用于体外检测NHP2核糖核蛋白的免疫学实验。
NHP2核糖核蛋白抗体是一组自身抗体，也属于抗核抗体。可见于35%～45%的系统性红斑狼疮病人和95%～100%的混合性结缔组织病病人，混合性结缔组织病是既有肌炎又有红斑狼疮和硬皮病特点的一类疾病。抗RNP抗体在其他自身免疫病检出率不高。其检测方法包括免疫印迹法和间接免疫荧光法以及酶联免疫吸附试验。它作为一种标记性抗体，在诊断和鉴别诊断红斑狼疮与混合性结缔组织病上有重要意义，但是与疾病的活动和稳定无关。
NHP2核糖核蛋白免疫组化图
核糖核蛋白：指包含有RNA的核蛋白，即将核酸和蛋白质结合在一起的一种形式。核糖核蛋白包括核糖体、端粒酶以及小核。
核糖体蛋白是蛋白质。真核细胞细胞核的蛋白质很多，比如染色体上的蛋白质。而核糖核蛋白体是核糖体的旧时称呼，在细胞质中，核糖体蛋白与rRNA结合成核糖体，起到翻译mRNA的作用。复合体可以使蛋白质，有很多蛋白质复合体。但是复合体不全是蛋白质。
应用[4][5]
用于石榴皮对非酒精性脂肪肝病的基因表达调控数据分析研究
首先从NCBI中的GEO数据库中下载基因芯片数据集GSE66316。利用QlucoreOmics Explorer3.0（QOE3.0）软件分析筛选“高脂饮食和石榴皮饲养8周”和“高脂饮食饲养8周”基因芯片数据中的差异表达基因。
然后,应用Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery（DAVID）对QOE 3.0筛选出来的差异表达基因进行基因功能富集分析。
最后,利用Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins（STRING）在线分析软件,建立基因编码蛋白关系网络图。
通过分析,最终确定石榴皮对NAFLD的基因表达调控主要集中在一系列差异表达基因;再进行文献挖掘分析,发现石榴皮可能通过对几个关键差异表达基因影响调节NAFLD的发生发展。QOE 3.0软件分析筛选出172个差异表达基因。
其中高表达基因118个,包括AAGAB、CAD、EXOC1、RPL10、TFB2M、RPS7、NHP2、TRUB1等;低表达基因54个,包括ISG15、OASL、NR3C1、AZGP1、BIRC5、RGMA等。DAVID分析发现这172个差异表达基因主要涉及RNA结合、修饰与加工,核糖体及其复合物的生物合成,蛋白质的转运和定位,翻译,一碳单位代谢,甲基化,GTPase的结合与活性结合,钙离子结合,多糖结合,核苷三磷酸酶活性调节,转录辅激活因子的活性,转录因子结合,核糖核蛋白复合体,线粒体,脂蛋白生物功能等生物过程、分子功能和细胞组分。
将172个差异基因导入STRING中,最终筛选出13个差异表达基因。对这13个基因进行文献挖掘和分析显示:石榴皮对NAFLD的治疗作用可能是通过上调LPL、CARM1、C1QBP、TFB2M等基因的表达,促进甘油三酯水解,减少其在肝脏中的蓄积;增强肝细胞的抗氧化应激能力以及维持线粒体功能的稳定,进而维持肝细胞的正常生物代谢;同时,还可能下调NR3C1基因的表达,降低血液中游离脂肪酸的浓度,缓解胰岛素抵抗,从而达到治疗NAFLD的功效。
而NHP2、RPL10、RPS7、CAD、PCK2、ISG15、OASL、TRUB1基因与NAFLD的关系尚未明确。
参考文献
[1]Liver Enzyme Levels and Hepatic Iron Content in Fatty Liver[J].Amir Reza Radmard,Hossein Poustchi,Mehrdad Dadgostar,Ali Yoonessi,Soheil Kooraki,Elham Jafari,Amir Pejman Hashemi Taheri,Reza Malekzadeh,Shahin Merat.Academic Radiology.2015(6)
[2]Glutathione and Thioredoxin Antioxidant Pathways Synergize to Drive Cancer Initiation and Progression[J].Isaac S.Harris,Aislinn E.Treloar,Satoshi Inoue,Masato Sasaki,Chiara Gorrini,Kim Chung Lee,Ka Yi Yung,Dirk Brenner,Christiane B.Knobbe-Thomsen,Maureen A.Cox,Andrew Elia,Thorsten Berger,David W.Cescon,Adewunmi Adeoye,Anne Brüstle,Sam D.Molyneux,Jacqueline M.Mason,Wanda Y.Li,Kazuo Yamamoto,Andrew Wakeham,Hal K.Berman,Rama Khokha,Susan J.Done,Terrance J.Kavanagh,Ching-Wan Lam,Tak W.Mak.Cancer Cell.2015(2)
[3]The Adiponectin‐SIRT 1‐AMPK Pathway in Alcoholic Fatty Liver Disease in the Rat[J].ZhiAn Jiang,JunYing Zhou,DongFang Zhou,ZhanTao Zhu,LiNa Sun,Amin A.Nanji.Alcohol Clin Exp Res.2015(3)
[4]Correlation of Gene Expression with Bladder Capacity in Interstitial Cystitis/Bladder Pain Syndrome[J].Marc Colaco,David S.Koslov,Tristan Keys,Robert J.Evans,Gopal H.Badlani,Karl-Erik Andersson,Stephen J.Walker.The Journal of Urology.2014
[5]林献威.石榴皮对非酒精性脂肪肝病的基因表达调控数据分析[D].南方医科大学,2017.