凝胶阻滞分析(EMSA)试剂盒(化学发光法)的应用

2021/6/21 9:09:27

背景[1-3]

凝胶阻滞分析(EMSA)试剂盒(化学发光法)是一种通过Streptavidin-HRP及ECL检测试剂来实现化学发光检测Biotin标记的EMSA探针的检测试剂盒。同时本试剂盒也提供EMSA检测所需的结合缓冲液和上样缓冲液,及一些关键的相关试剂,可以实现非同位素的EMSA检测。

凝胶阻滞图

凝胶阻滞分析(Gel shift Assay,Gel Retardation),该方法用来研究DNA与特异性蛋白的相互作用,通常是放射性标记的DNA片段与纯化蛋白,或提取物中的蛋白混合物相结合,然后在非变性凝胶中分析该产物。与游离DNA相比,蛋白-DNA复合物的迁移率将降低,因此,与游离DNA相对应,人们将观察到带中的“阻滞”。

原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针结合,电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后。该方法可用于检测DNA结合蛋白、RNA结合蛋白,并可通过加入特异性的抗体(supershift)来检测特定的蛋白质,并可进行未知蛋白的鉴定。

凝胶阻滞分析(EMSA)试剂盒采用了高质量的Streptavidin-HRP Conjugate,HRP和Streptavidin共价交联的比例大于3,这样比采用Streptavidin和Biotin-HRP conjugate两种试剂进行检测要更方便,并且灵敏度更高。

凝胶阻滞分析(EMSA)试剂盒采用了非特异性结合比avidin更低的strepatavidin,使检测结果背景更低灵敏度更高。EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X)中含有poly(dI-dC)等有效成分。其中poly(dI-dC)的浓度经过优化,可以很好的消除蛋白和标记探针间的非特异性结合,同时又不会减弱目的转录因子和标记探针间的结合。

凝胶阻滞分析(EMSA)试剂盒可以用于20个蛋白和探针的结合反应,并足够检测至少2块有生物素标记EMSA探针的膜。

应用[4][5]

用于钝齿棒杆菌ArgR的凝胶阻滞实验及单增李斯特菌actA、inlB、p60表达载体的构建

构建了ArgR的重组表达菌株BL21(DE3)/pET22b-argR。在33℃,以IPTG诱导8h实现了ArgR高效可溶性表达。用纯化后的ArgR制备小鼠多克隆抗体,间接ELISA检测抗体效价达1:160000。Western blotting结果表明,ArgR重组蛋白在体外可自发形成具有生物活性的多聚体。

在钝齿棒杆菌精氨酸代谢途径中,可能受到ArgR调节的基因有六个:argC、argJ、argB、argG、argF以及carAB。为验证ArgR对以上基因上游DNA序列的结合作用,分别将其与ArgR进行凝胶阻滞实验,结果表明,ArgR对位于argB、argF以及carAB上游的DNA序列均有结合反应,其中ArgR对carAB上游的DNA序列结合能力最为显著。

实验通过PCR扩增获得LM actA、inlB、p60全长,并将克隆至原核表达载体pET22b(+)中,构建了重组表达载体pET22b(+)pET22b(+)-inlB以及pET22b(+)-p60,为大量表达单增李斯特菌特异性膜蛋白抗原奠定了实验基础。

参考文献

[1]Improvement of L-arginine production by overexpression of a bifunctional ornithine acetyltransferase in Corynebacterium crenatum.[J].Dou Wenfang,Xu Meijuan,Cai Dongmei,Zhang Xiaomei,Rao Zhiming,Xu Zhenghong.Applied biochemistry and biotechnology.2011(3-4)

[2]Interaction of transcriptional repressor ArgR with transcriptional regulator FarR at the argB promoter region in Corynebacterium glutamicum.[J].Lee Soo Youn,Park Jae-Min,Lee Jin Hyung,Chang Suk-Tai,Park Jin-Soo,Kim Yang-Hoon,Min Jiho.Applied and environmental microbiology.2011(3)

[3]Offering surprises:TCA cycle regulation in Corynebacterium glutamicum[J].Michael Bott.Trends in Microbiology.2007(9)

[4]Use of Monoclonal Antibodies That Recognize p60 for Identification of Listeria monocytogenes[J].Kang Y.Yu,Youngsoon Noh,Minsub Chung,Hong J.Park,Namseok Lee,Moonyeon Youn,Byeong Y.Jung,Byung S.Youn.Clin.Diagn.Lab.Immunol..2004(3)

[5]袁永.钝齿棒杆菌ArgR的凝胶阻滞实验及单增李斯特菌actA、inlB、p60表达载体的构建[D].南昌大学,2012.

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