和其他抗氧化剂一样，黄烷醇也有摧毁自由基的作用。特别重要的是，黄烷醇可以有效抑制自由基诱导的负面身体化学变化。这种抗氧化剂还被认为有预防血栓的功效。一些研究已经证实黄烷醇化合物能够降低血液中的低密度脂蛋白（坏胆固醇）水平。
最近几年，一些实验结果显示可可黄烷醇有促进提高大脑血流量的作用。尽管还需要更多研究证实，但早期的研究结果已经证实这种物质能够通过加强脑化学品帮助修复情绪平衡。如果进一步实验能够证实这一理论，就意味着富含这种抗氧化剂的可可可以帮助治疗抑郁，焦虑，甚至老年痴呆症。
可可包含的黄烷醇数量比巧克力高很多。这意味着通过吃巧克力提高黄烷醇水平不会有很好的效果，甚至还有可能导致血糖水平骤然升高。此外，巧克力黄烷醇脂肪含量较高，而可可的脂肪含量很少。因此，消费含这种抗氧化剂丰富的可可不容易导致体重增加，动脉血栓，和血糖水平骤然变化等问题。
在饮食中包含富含黄烷醇的食物可以有效提高身体器官功能。通过控制自由基，这种抗氧化剂能够支持免疫系统健康，增强身体抵御细菌和疾病的能力。