磷酸川芎嗪有抗血小板聚集，扩张小动脉，改善微循环和活血化淤作用。并对已聚集的血小板有解聚作用。为外周作用的抗肾上腺素能药。用于缺血性脑血管疾病（如脑供血不足、脑血栓形成、脑栓塞）。一般都是采用口服的方式，一次50-100mg（1-2粒），一日3次，一个月为一疗程或遵医嘱。
盐酸川芎嗪动物静脉滴注后，可使心肌收缩力加强，心脑血管扩张，脑血流增加；另外，尚能拮抗血小板聚集及释放，降低血液粘度。用于治疗缺血性脑血管疾病如脑供血不足、脑血栓形成，脑血栓及其他缺血性血管疾病如冠状动脉粥样硬化性心脏病，脉管炎等。
磷酸川芎嗪胶囊和盐酸川芎嗪药物的合成方法不同，只是酸根不同，治疗的症状是比较相似的。盐酸川芎嗪患者服用后可能会出现口干，嗜睡等不良反应，磷酸川芎嗪胶囊除了这些不良反应之外可能还会出现胃部不适的症状。
磷酸川芎嗪胶囊和盐酸川芎嗪的效果都是比较不错的，但药物疗效存在一定的个体差异，不同患者对于这两种药物的敏感性不同，在治疗过程中可能存在部分患者对于其中一种药物疗效较好的情况。患者还需结合自己的实际病情来选择适合自己的药品。