CHIRP试剂盒

CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同时分析lncRNA/circRNA 、蛋白及DNA三者互作关系。利用ChIRP-seq技术可用于在全基因范围内定位lncRNA/circRNA的结合位点和可能结合的其他RNA分子,是揭示位于细胞核内lncRNA/circRNA 生物学机制的关键实验手段。该方法是通过设计与目标RNA序列反向互补的生物素探针，把目标RNA拉下来以后，与其共同作用的DNA染色体片段就会附到链霉亲和素磁珠上，最后通过qRT-PCR或测序来测定目的RNA、DNA序列，亦或是通过Western或质谱分析来测定蛋白。ChIRP（Chromatin Isolation by RNA Purification）运用于研究RNA与DNA、RNA及蛋白质之间相互作用的实验。根据研究对象不同，ChIRP技术结合了高通量测序（ChIRP-Seq）和质谱技术（ChIRP-MS）分别研究与目标RNA互作的基因和蛋白质。ChIRP技术是通过设计生物素探针组，通过碱基互补配对将目标RNA特异性拉下的同时会富集与其互作的DNA、RNA或蛋白质（RBPs），最后将基因开展高通量测序或PCR，可以得到该调控RNA转录调控的下游靶基因。与此同时，RBPs可以开展Western Blot验证或者MS鉴定。