磺化Cy3活化酯
| 中文名称 | 磺化Cy3活化酯 |
|---|---|
| 中文同义词 | 磺酸-CY3-琥珀酰亚胺酯;二磺酸-CY3-琥珀酰亚胺酯;磺化CY3-NHS 活化酯;磺化CY3活化酯;SULFO-CYANINE3 NHS ESTER,SULFO-CY3 NHS ESTER;磺酸基CY3-活性酯(甲基);磺酰基CY3 NHS酯钠盐;磺化CY3活化酯钠盐 |
| 英文名称 | Sulfo Cyanine3 NHS ester |
| 英文同义词 | diSulfo-Cy3 NHS ester;Sulfo-Cyanine3 NHS ester，Sulfo-Cy3 NHS ester;diSulfo-Cy3 NHS ester(Methyl);Sulfo-Cy3 NHS Ester Sodium Salt;Sulfo-Cy3 NHS eater;Sulfo-cyanine3 NHS ester sodium;Sulfo-Cy3-M SE (Orange Red);(2R,3S,5R)-5-(4-acetamido-2-oxo-5-((triisopropylsilyl)ethynyl)pyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl (2-cyanoethyl) diisopropylphosphoramidite |
| CAS号 | 1424150-38-8 |
| 分子式 | C34H40N3NaO10S2 |
| 分子量 | 737.81 |
| EINECS号 | |
| 相关类别 | 化学试剂 |
| Mol文件 | 1424150-38-8.mol |
| 结构式 |  |
磺化Cy3活化酯 性质
| 溶解度 | 溶于水、DMSO、DMF、DCM |
|---|---|
| 外观 | Red solid |
| 激发峰(Ex)/发射峰(Em) | 550/566 nm (PBS buffer) |
| ε(消光系数) | 162000 L⋅mol−1⋅cm−1 |
| Φ(量子产率) | 0.1 |
磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。 磺化Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸等各种生物分子。
NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化磺化Cy3分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把染料分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），磺化Cy3-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy3-NHS反应。
磺化Cy3-NHS活化酯的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-NHS标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
NHS活化酯 （N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化磺化Cy3分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把染料分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），磺化Cy3-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和磺化Cy3-NHS反应。
磺化Cy3-NHS活化酯的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记蛋白等对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到蛋白表面后不会引发疏水性蛋白聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-NHS也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-NHS标记后的产物Ex/Em是550/566nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
- NHS ester基团对湿度比较敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20分钟。
- 使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液；或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
- 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊。
化学性质
水溶性Cy3 活性酯，CAS号：1424150-38-8（钠盐），深红色晶体，在水中很高，在极性有机溶剂（DMF，DMSO）中很好。储存条件：在-20°C中24个月。运 输：室温下长达3周。避免长时间接触光线，变干。用途
氨基活性sulfo-Cyanine3 NHS ester。水溶性，氨基反应性硫氰酸-NHS酯。在纯水溶液中标记蛋白质和肽，无需有机溶剂。适用于低溶解度和易变性的蛋白质。这是一种磺化、亲水、水溶性染料。没有磺化的Cyanine3 NHS ester亦可供选择。该产品是Cy3 NHS ester的衍生物。在所有应用中Sulfo-Cyanine3 NHS ester都可以替代Cy3,Alexa Fluor 546和DyLight 549。