RNA PULLDOWN试剂盒
中文名称 | RNA PULLDOWN试剂盒 |
---|---|
中文同义词 | RNA PULLDOWN试剂盒 |
英文名称 | RNA pulldown Kit |
英文同义词 | RNA pulldown Kit;RNA-Protein Pull Down Kit |
CAS号 | |
分子式 | |
分子量 | 0 |
EINECS号 | |
相关类别 | 表观遗传试剂盒;表观遗传 |
Mol文件 | Mol File |
结构式 |
RNA PULLDOWN试剂盒 性质
蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等,了解它们之间相互作用的分子机制对理解这些生物学过程非常重要。RNA pulldown技术利用脱硫生物素末端标记的RNA和链霉亲和素标记的磁珠高效富集及鉴定RNA结合蛋白质(RBPs)。 RNA pulldown技术利用脱末端标记的RNA高效富集及鉴定RNA结合蛋白(RBPs)。此方法避免了抗体的使用,大大延伸了使用范围。随着RNA pulldown技术的不断完善,其在生命科学研究及医学领域中扮演的角色愈加重要。RNA pull-down实验就是先将RNA进行标记(如生物素探针标记),再与细胞裂解液共同孵育,从而形成RNA-蛋白质复合物,之后再分离复合物得到蛋白质,通过western blot 或mass Spectrometry检测蛋白质的技术。体外转录合成生物素标记的目标lncRNA(包括环状RNA)(包含用作正负对照的RNA片段),
与细胞抽提物孵育;用亲和素锚定磁珠收集RNA-蛋白质或RNA-RNA复合物,充分洗涤后洗脱复合
物。若检测与lncRNA(包括环状RNA)相互作用的蛋白质靶分子,则对RNA-pull down产物进行
蛋白质电泳分离,银染检测目标蛋白,并切胶进行质谱分析;也可对pull-down产物直接进行
western blot验证;若检测与lncRNA(包括环状RNA)相互作用的RNA靶分子,则对RNA-pull
down产物进行RNA抽提,并进行特异性的qRT-PCR检测。针对目标区域设计脱硫生物素标记的特异性RNA探针,并与细胞蛋白提取物孵育。通过偶联磁珠,经洗脱,得到目的RNA探针-蛋白质复合物。最后采用Western Blot或质谱鉴定蛋白质类型。