中文名称:5'-荧光素氨基磷酸酯
英文名称:5'-Fluorescein Phosphoramidite
一、定义
5'-荧光素氨基磷酸酯是一种专为核酸(DNA/RNA)5'端标记设计的荧光修饰试剂,其核心结构由三部分组成:
荧光素发色团:基于异硫氰酸荧光素(FITC)的衍生物,发射明亮的黄绿色荧光(Ex/Em≈495nm/520nm)。
氨基磷酸酯保护基:含二异丙基氨基(iPr₂N)和氰基乙基(CE)保护基团,确保合成过程中化学稳定性。
磷酸三酯连接臂:通过磷酸酯键与核酸5'端羟基(-OH)共价结合,形成稳定的标记复合物。
二、荧光特性与理化性质
荧光颜色:黄绿色荧光,与DAPI(蓝色)、Cy3(橙红色)形成互补,适用于多色荧光共定位实验。
溶解性:易溶于无水乙腈(ACN)、二氯甲烷(DCM)等有机溶剂,需避光保存于-20℃以防止光降解。
稳定性:在pH 5-9范围内稳定,量子产率达0.92,光稳定性优于传统荧光素(半衰期延长3倍)。
三、核心应用领域
核酸合成与标记:
寡核苷酸探针:标记引物或探针,用于实时荧光定量PCR(qPCR)、SNP分型及突变检测。
基因芯片:制备荧光标记的DNA微阵列,实现高通量基因表达谱分析。
RNA标记:标记mRNA或siRNA的5'端,研究RNA定位、降解及翻译效率。
细胞成像与追踪:
标记反义寡核苷酸(ASO),通过荧光显微镜观察其在细胞内的分布及核质转运。
结合荧光原位杂交(FISH),定位染色体特定基因区域。
四、应用优势
高效标记:通过自动化核酸合成仪直接引入,标记效率>95%。
低背景干扰:荧光素光谱与常见染料(如TRITC)分离度高,减少串色风险。
成本可控:国内企业(如上海生工、百奥迈科)已实现规模化生产,价格较进口产品降低30%。