试剂基础档案:
英文名称:Methyl (S)-2-(4-(4'-((4-(N-(3-cyano-4-methyl-1H-indol-7-yl)sulfamoyl)benzyl)carbamoyl)-[1,1'-biphenyl]-4-yl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl)acetate , IBG1
中文名称:(S)-2-(4-(4'-((4-(N-(3-氰基-4-甲基-1H-吲哚-7-基)氨磺酰基)苄基)氨基甲酰基)-[1,1'-联苯]-4-基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸甲酯
CAS 号:2684292-71-3
分子式:C44H38N8O5S2
分子量:822.95
纯度:>95%
货号:Y-YK-3036
外观性状:白色至黄色固体(White to yellow solid)
储存条件:-20℃以下冰冻、干燥、避光。
溶解条件:易溶于DMSO、DMF、二氯甲烷等有机溶剂,微溶于甲醇,难溶于水
供应商:西安强化生物科技
注意事项:避免频繁解冻,现配现用,保持干燥,避光。
试剂结构式

✨ 核心结构特点
双配体"顺式桥接"设计:分子由两段识别单元经连接臂拼接——一端为 JQ1 型 BET 溴结构域配体(2,3,9-三甲基噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂䓬骨架,(6S) 单一构型、6 位为乙酸甲酯),另一端为吲哚磺酰胺类 DCAF 配体(3-氰基-4-甲基-1H-吲哚-7-基氨磺酰结构,即 E7820 型芳基磺酰胺),中间由联苯–酰胺–苄基连接臂桥连
"分子内二价胶"的核心逻辑:不同于 PROTAC 以"靶点配体–连接子–E3 配体"反式(trans) 连接两个蛋白,IBG1 以顺式(cis) 方式同时结合 BRD4 的两个相邻溴结构域,诱导靶蛋白构象重排,从而把 BRD4 与 E3 连接酶"粘"在一起
"粘合"而非单纯"招募":降解依赖 BRD4 与 DCAF16 的内在亲和力(该亲和力在无化合物时不足以引发降解),IBG1 通过桥接两个结构域放大这一相互作用——这正是新机制的要点
机制已获结构生物学验证:BRD4–IBG1–DCAF16 三元复合物结构已解析(PDB 8OV6),并据此理性设计出低皮摩尔效力的改良降解剂
分子量核算可查:8 个氮(噻吩并三唑并二氮杂䓬 4 个 + 吲哚环/氰基/氨磺酰 3 个 + 酰胺 1 个)、5 个氧、2 个硫,与登记式 C₄₄H₃₈N₈O₅S₂ 相符
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