抗氧化功能
生物体内各种自由基的产生与清除应处于动态平衡，即机体内的自由基要始终保持一定水平。自由基过多或过少对机体都不利。过多时，会促进机体衰老引发各种疾病，包括癌症、心脏病等；过少时，也会影响健康甚至阻碍正常代谢或诱发另一类疾病。PQQ通过以下几方面机制防止机体氧化损伤。
动物细胞组织和体液中的游离态PQQ是以醌型、氢醌型和半醌型存在的，它可催化氧与O2-相互转化，从而帮助机体维持自由基平衡。
PQQ与超氧化物歧化酶(SOD)结合形成一个广谱的产生过氧化氢的氧化酶系统从而抑制超氧阴离子自由基对细胞的伤害: SOD作为脱辅基酶蛋白，PQQ作为非共价结合的氧化还原辅基。
PQQ通过加速“NAD+→NADH”的反应，将被利用后的氧化型谷胱甘肽（GSSG）更快地转化为还原型谷胱甘肽（GSH）。
PQQ本身还具有很强的清除该自由基的能力，相当于抗坏血酸的50~100倍[12]。
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