3，5-双(三氟甲基)苯基异硫氰酯主要用作医药合成中间体，如制备一系列含芳香胺结构的硫脲类化合物，该系列化合物与药物靶标具有良好的匹配模式，对体外肿瘤细胞株具有良好的抑制活性，可作为有效成分用于制备肿瘤方面的治疗药物。
3，5-双(三氟甲基)苯基异硫氰酯的合成：在250mL三口烧瓶中加入3，5-双(三氟甲基)-4-氯苯胺(25.8g，132.3mmol)、三乙烯二胺(44.46g，396.9mmol)和135mL甲苯，室温搅拌溶解。然后2.0h内滴加二硫化碳(30.06g，396.9mmol)，滴完后于15-25℃保温反应8-10h，反应结束后，抽滤，滤饼用20mL甲苯淋洗一次，烘干，得到淡黄色粉末状3，5-双(三氟甲基)-4-氯苯胺二硫代甲酸盐。将所得的3-三氟甲基-4-氯苯胺二硫代甲酸盐悬浮于200mL氯仿中，开动搅拌冷至-5-0℃。慢慢滴加溶有固体光气【二（三氯甲基）碳酸酯，BTC】(12.43g，42.0mmol)的60mL氯仿，滴完后，冰浴反应1h，然后室温反应1h，最后加热至回流，保温1.5-2h。反应结束后，冷却至室温，抽滤除去不溶物，滤液减压蒸馏，得到3，5-双(三氟甲基)苯基异硫氰酯粗品。经柱层析（硅胶G，纯石油醚洗脱，减压浓缩得到淡黄色油状液体23.5g，纯度：99.6%(GC)，bp：248-251℃，收率：80.5%。