N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯在药物合成中的应用

2023/7/12 9:10:16

N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯在药物合成中的应用

新型Boc保护环丙烷修饰脯氨酸类似物的合成

环丙烷修饰的脯氨酸库的新成员,受Boc保护的5-氮杂螺[2.4]庚烷-6-羧酸的Boc衍生物的合成。起始原料(2S,4R)-4-羟脯氨酸(13)转化为N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯。然后采用维蒂希反应对14的烯化反应。Tebbe试剂(16)是烯烃化的可能替代品。反应顺利进行,得到(S)-15作为单一对映异构体,收率25%(柱层析后)和>98%ee。[1]

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赖氨酸和高谷氨酸构象约束类似物的简单合成

从市售的反式-4-羟基-l-脯氨酸中轻松合成了新型氨基酸反式-4-氨基乙基-L-脯氨酸和反式-4-羧甲基-L-脯氨酸。这些构象受限的L-赖氨酸和L-高谷氨酸类似物是有用的脯氨酸模板氨基酸(PTAA),在蛋白质工程和从头蛋白质设计中具有潜在的应用。

4-羟基-L-脯氨酸盐酸盐(3)转化为其相应的Nα-叔丁氧羰基丙烯酸甲酯4经两次反应,一锅用甲醇HCl处理,然后用Boc酐/二异丙基乙胺处理,总收率91%。反式-N的双相氧化α-叔丁氧羰基-4-羟基-L-脯氨酸甲酯 4 至 N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯5在94%的收率。

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氰甲基衍生物7a通过碱性水解1N NaOH定量转化为Boc脱保护的二酸1,随后用TFA处理。该化合物是l-高谷氨酸的约束版本,并且具有与报告值相同的光谱数据。此外,新型反式4-氨基乙基-L-脯氨酸2构象约束的L-赖氨酸类似物的TFA盐也是通过在氧化铂上加氢7a获得的,产率为63%。[2]

赖氨酸和高谷氨酸构象约束类似物的简单合成-2.jpg

2,4-乙脯氨酸的合成

(2S,4R)-4-羟基脯氨酸转化为受保护的衍生物3。氧化生成N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯4。研究发现,使用LHDMS作为碱的Wittig-Horner烯化4的产率比近藤等人用于合成类似化合物的Peterson烯化具有更好的5(85%,E / Z混合物)。5的氢化以非对映选择性方式进行,导致6的形成(通过NMR高达84%de)。6中保护基团的变化伴随着后续步骤所需的侧链羧基脱保护, 7 通过混合酸酐还原得醇8。 通过NOESY测量分配分子手性中心的相对构型(观察到吡咯烷部分的2-C H和4-CH之间的相关性)。化合物8经溴化反应得到溴化物9。由KHMDS诱导的9环化反应导致所需的2,4-乙脯氨酸衍生物10a的产率很高,该衍生物通过酸性水解转化为氨基酸1a(盐酸盐)。[3]

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抑制剂MRTX1133关键中间体的制备

Xiaolun Wang报道了个非共价的、有效的、选择性的KRASG12D抑制剂MRTX1133的发现和表征,MRTX1133是通过广泛的基于结构的活性改善发现的,并显示在KRASG12D突变异种移植小鼠肿瘤模型中验证有效。

Wenxing Guo等使用现成的N-Boc-反式-4-羟基-l-脯氨酸甲酯(8)作为起始材料。通过氧化得到N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯、再还原和脱氧氟化,其二级醇立体中心进行双重转化,提供反式-4-氟-l-脯氨酸(13)。随后通过Seebach的手性再现方法在α-羰基位置引入三碳合成子导致化合物15并以立体选择性方式建立所需的四元中心。(13)最后,脱保护和环化将形成双环核心,在还原后得到最终产物1。1是合成抑制剂MRTX1133关键中间体。[4]

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3-亚甲基吡咯烷甲酰羟基氨基衍生物的合成

3-亚甲基吡咯烷甲酰羟基氨基衍生物研究发现P1′和 P3′这些衍生物中的大多数表现出比现有药物更好的体外抗菌活性,可对抗耐药临床分离株,包括MRSA,PRSP和流感嗜血杆菌。

3-亚甲基吡咯烷甲酰羟基氨基衍生物1a-1n的一般合成如图1所示。从N-Boc-反式-4-羟基-l-脯氨酸(2)的甲酯开始。2的Swern氧化得到相应的酮3、N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯具有良好的收率。[5]

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TfmPro的合成

合成γ-(S)-三氟甲基脯氨酸,如N-Boc(1),其衍生物Ac-TfmPro-OMe(8)用于构象分析,以及短杆菌肽S类似物用于固态19F核磁共振。X射线晶体结构为8(碳-蓝,氧-红,氟-绿,氮-紫)。

简单经济的N-Boc衍生物1的合成,由Qiu&Qing报道,从羟脯氨酸2开始。采用甲酯保护,并以96%的产率获得了受保护的羟脯氨酸。使用氧化铬-吡啶(柯林斯试剂)将羟基转化为N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯(4),产率为76%(。对于放大合成,我们改为Parikh-Doering氧化,并将产量提高到4%至90%。[6]

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标记物4-OH-4-氘脯氨酸甲酯的合成

通过还原N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯合成4-OH-4-氘脯氨酸甲酯,NaBD4还原,然后水解。研究发现,喂食的4-OH-4-在六环肽中无法检测到氘-脯氨酸,这表明4-OH-4-氘脯氨酸不是NRPS生物合成的组成部分。4-OH六环肽中的脯氨酸残基可能在NRPS生物合成或OH-脯氨酸残基是3-OH-脯氨酸(在天然产物中不常见)。[7]

标记物4-OH-4-氘脯氨酸甲酯的合成.jpg

4,4-二氟脯氨酸衍生物的合成

用PDC处理22得到的N -BOC- 4 -羰基- L -脯氨酸甲酯为原料,通过氟化(DAST)合成4,4-二氟脯氨酸衍生物3j13(方案7)。[8]

4,4-二氟脯氨酸衍生物的合成.jpg

参考文献

[1] Tymtsunik A V, Bilenko V A, Ivon Y M, et al. Synthesis of a novel Boc-protected cyclopropane-modified proline analogue. Tetrahedron Letters, 2012, 53(30): 3847-3849.

[2] Barkallah S, Schneider S L, McCafferty D G. Facile syntheses of conformationally constrained analogues of lysine and homoglutamic acid. Tetrahedron letters, 2005, 46(30): 4985-4987.

[3] Grygorenko O O, Komarov I V, Cativiela C. A novel approach to 2, 4-ethanoproline[J]. Tetrahedron: Asymmetry, 2009, 20(12): 1433-1436.

[4] Guo W, Gharbaoui T, Lizza J R, et al. Practical Asymmetric Synthesis of a Bicyclic Pyrrolidinol. Organic Process Research & Development, 2022, 26(10): 2839-2846.

[5] Shi W, Ma H, Duan Y, et al. Design, synthesis and antibacterial activity of 3-methylenepyrrolidine formyl hydroxyamino derivatives as novel peptide deformylase inhibitors[J]. Bioorganic & medicinal chemistry letters, 2011, 21(3): 1060-1063.

[6] Kubyshkin V, Afonin S, Kara S, et al. γ-(S)-Trifluoromethyl proline: evaluation as a structural substitute of proline for solid state 19 F-NMR peptide studies[J]. Organic & Biomolecular Chemistry, 2015, 13(11): 3171-3181.

[7] Wang W X. Crosstalk and antibacterial molecules from endophytes harbored in Narcissus tazetta and Buxus sinica[D]. Dissertation, Dortmund, Technische Universit?t, 2016, 2016.

[8] Chiba J, Takayama G, Takashi T, et al. Synthesis, biological evaluation, and pharmacokinetic study of prolyl-1-piperazinylacetic acid and prolyl-4-piperidinylacetic acid derivatives as VLA-4 antagonists. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2006, 14(8): 2725-2746.

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