PCR产物纯化回收试剂盒

2020/4/22 8:46:48

概述[1]

本试剂盒适用于从 PCR 反应液或各种酶促反应液中纯化回收 DNA 片段。该试剂盒采用特殊的吸附膜,能够有选择性地吸附核酸分子,去除反应液中的各种酶蛋白、引物、dNTP 等,得到高质量的 DNA 纯化产物,可直接用于酶切、测序等后续的分子生物学试验。本试剂盒具有以下特点:

1.适用范围广,回收效率高。

2.操作简单快速,整个回收过程仅需 5 分钟左右。

3.洗脱效率高,洗脱体积最小可低至 15μl。 

试剂盒组成[1]

保存方法及注意事项[1]

本试剂盒在室温(15-25℃)干燥保存,有效期见包装。Buffer B3 中含有刺激性的化合物,操作过程中应穿上实验服,戴好乳胶手套,避免沾染皮肤、眼睛和衣服,防止吸入口鼻。沾染皮肤或眼睛后,请立即用清水或生理盐水冲洗,必要时寻求医生的帮助。 

标准抽提步骤[1]

自备材料:水浴锅、小型高速离心机(离心力≥12,000 ×g)、1.5 mL 离心管、无水乙醇、异丙醇等。按瓶身标签说明在 Wash Solution 中加入相应量的无水乙醇(乙醇终浓度为 80%),混匀后在瓶身做好标记。于室温密封保存。按瓶身标签说明在 Buffer B3 中加入相应屋的异丙醇(异丙醇终浓度为 20%),混匀后在瓶身做好标记。密封于室温保存。每次使用前请检查 Buffer B3 是否出现沉淀,如有沉淀,请于 37℃溶解沉淀,待冷却至室温后使用。

1. 将 PCR 反应液或酶促反应液移至一干净的 1.5 mL 离心管中,加入 3 倍体积的Buffer B3,充分混匀。首次使用前请先检査是否已加入适置的异丙醇。若反应液体积过小,可用 TE 或水补足至 100μl,然后再加入 300μl Buffer B3。

2. 将混合液全部移入吸附柱,8,000 ×g 离心 30 sec。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。如果体系总体积大于 750μl,则每次使用 750μl,多次上柱。将滤出液再次加入吸附柱中再次过柱,可以进一步提高 DNA 回收率。

3. 向吸附柱中加入 500μl Wash Solution, 9,000 ×g 离心 30 sec。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。Wash Solution 首次使用前请检査是否已加入正确量的无水乙醇。

4. 重复步骤 3 一次。

5. 将空吸附柱和收集管放入离心机,9,000 ×g 离心 1 min。此步绝不可省略,否则残余的乙醇会严重影响得率和后续实验。

6. 在吸附膜中央加入15-40μl Elution Buffer,室温静置l-2min,9,000 ×g离心1 min。将所得到的 DNA 溶液罝于-20°C 保存或用于后续试验。

Elution Buffer 为 2.5mM Tris-HCI,pH 8.5,可以用 TE 或水(pH >7.0)代替。将 Elution Buffer 预热至 60°C 可以进一步提高得率。如果片段>4kb,在 37-60°C 温浴 2 分钟可以显著提高得率。请勿使用小于 15μl 的洗脱液进行洗脱。

常见问题解答[1]

1. PCR 产物回收效率较低或者未回收到目的片段

A. Wash Solution 中未加入正确量的无水乙醇。

B. 提高 Buffer B3 的相对浓度,增加 DNA 与吸附膜的作用时间(静罝时间),在一定程度上可以提高回收率。

C. 如果纯化的片段长度大于 4 kb 或者目的片段含量较少,可将洗脱液再次加入吸附柱进行洗脱,以提高回收效率。

D. 洗脱液加入位置不正确:洗脱液应加在硅胶膜的中心部位,以完全覆盖硅胶膜的表面,达到的洗脱效率。

E. 洗脱液不合适:洗脱缓冲液的 pH 值对洗脱效率有影响,如果使用水进行洗脱,请确保其 pH 值>7.0,pH 值过低可能导致低洗脱效率。

F. 洗脱时将洗脱液预热至 60°C 后使用,有利于提高洗脱效率。

G. 洗脱时间过短:洗脱时间对回收率也有影响。洗脱时放置 1min 可达到较好的效果。

2. 回收的 PCR 产物进行后续酶切或者连接效率低

A. 若洗脱产物中含有残留的乙醇会影响酶切。可将空柱离心后的吸附柱开盖室温晾干2-5min,有助于残留的乙醇挥发完全。

B. 盐分的残留。请确保使用 Wash Solution 洗涤两次,每次 500μl 沿管壁加入,有助于彻底去除管壁上的盐份。

C. 回收后的 PCR 产物在反复冻溶的情况下,会加速末端 A 和整个 PCR 产物的断裂,从而造成与 T 载体的分子数比例,有助于提高连接效率。

3. 回收的片段为什么电泳上样会漂起来?

A. 主要原因是纯化过程中的乙醇没有去除干净。可将离心后的吸附柱开盖室温干燥 2-5min,有助于残留的乙醇挥发完全。

主要参考资料

[1] 柱式 PCR 产物纯化试剂盒产品说明书

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