作用机制
临床上，因黄连素的广谱抗菌作用，常用于痢疾、胃肠炎治疗等，故有“植物抗菌素”之称。黄连素口服后一般停留在肠道中，故副作用较少。最新临床研究发现，黄连素可以降低高血脂（高胆固醇和甘油三酯）约30%，因而广受重视。
功效与作用
盐酸黄连素具有以下作用：
广谱抗菌：包括抑制如痢疾杆菌、结核杆菌、溶血性链球菌，金黄色葡萄球菌，淋球菌、肺炎球菌、伤寒杆菌和白喉杆菌等。其中，对痢疾杆菌作用最强，故常用于胃肠炎、腹泻等消化道疾病，且副作用小。不过，痢疾杆菌、溶血性链球菌、金葡菌等极易对本品产生耐药性。
抗真菌、抗病毒：对流感病毒、阿米巴原虫、钩端螺旋体、某些皮肤真菌也有一定抑制作用。
降血脂：临床研究显示，口服小檗碱连续3个月剂量1000mg/天，可降低25-35%的总胆固醇、低密度脂蛋白(“坏”胆固醇）和甘油三酯等。
抗心力衰竭、抗心律失常：最新研究发现，小檗碱具有抗炎、降压等功效，对心衰、心律失常患者有改善作用。
糖尿病与肥胖：最新研究显示，口服小檗碱可激活AMPK（一磷酸腺苷活化蛋白激酶）而促进葡萄糖代谢、脂肪代谢等，增强葡萄糖耐受性及抑制脂肪合成。
黄连素在临床中一直作为非处方药用于治疗腹泻，但是现代药理学研究证实黄连素具有显著的抗心力衰竭、抗心律失常、降低胆固醇、抗制血管平滑肌增殖、改善胰岛素抵抗、抗血小板、抗炎等作用，因而在心血管系统和神经系统疾病方面将可能有广泛、重要的应用前景，日益受到重视。
安全注意事项
按照推荐剂量服用，基本是安全的，不建议长期服用。
少数人可能出现恶心、呕吐和便秘等不良反应。
小儿不宜食用黄连素，因可能引起核黄疸。
孕妇、哺乳妇存在安全隐患，不宜食用，因小檗碱/黄连素可能干扰幼儿肝功能（核黄疸），哺乳妇也不应使用它。