氯唑西林钠一水合物的晶体结构

2026/9/23 8:01:00 作者:电离式

介绍

氯唑西林钠一水合物是临床广泛应用的耐酶青霉素类抗生素,通过抑制细菌细胞壁肽聚糖合成发挥杀菌作用,对产青霉素酶的金黄色葡萄球菌等革兰阳性菌具有良好抗菌活性,被列入世界卫生组织基本药物目录,是基层医疗体系的核心抗感染药物之一。作为 β- 内酰胺类抗生素的钠盐晶型,其晶体结构直接决定药物的物理稳定性、溶出速率与生物利用度。通过同步辐射 X 射线粉末衍射技术结合密度泛函理论计算,能够解析氯唑西林钠一水合物的精确晶体结构,揭示其阳离子配位模式、氢键网络与分子堆积规律。

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图一 氯唑西林钠一水合物

晶体结构

氯唑西林钠一水合物的晶体结构以钠离子的配位聚合链为核心骨架。其晶胞参数经精修后为 a=7.98936 (12) Å、b=10.91809 (10) Å、c=25.5593 (6) Å,晶胞体积 2229.50 (5) ų,每个晶胞包含 4 个氯唑西林钠与 4 个结晶水。晶体的最显著结构特征是沿 a 轴延伸的、通过共角连接的不规则 NaO₅多面体链:每个钠离子采取五配位模式,配位氧原子分别来自羧基的两个氧原子、相邻分子的一个羰基氧原子、一个结晶水分子,以及桥联两个钠离子的羧基氧原子。其中羧基基团发挥双重配位功能:一方面以双齿螯合方式与单个钠离子结合,另一方面通过其中一个氧原子桥联相邻的另一个钠离子,成为连接多面体链的关键节点。Mulliken 重叠布居分析显示,Na-O 键的重叠布居在 0.04~0.05 e 之间,表明化学键以离子性为主,但兼具部分共价特征;键价计算得到钠离子的键价和为 1.14,略高于形式价态,反映出配位环境略显拥挤。这种一维配位链结构是青霉素钠盐常见的晶体组装模式,也是维持晶体结构稳定性的主要作用力之一。

丰富的氢键网络进一步稳定了氯唑西林钠一水合物晶体结构,结晶水分子在其中发挥关键的桥梁作用。结构中存在多种类型的氢键:结晶水分子作为双质子给体,分别与羧基氧 O22 和 β- 内酰胺环的羰基氧 O7 形成强 O-H⋯O 氢键,键能分别达到 12.8 kcal/mol 与 11.6 kcal/mol,是分子间作用的主要来源;同时水分子又作为质子受体,接受来自甲基 C16 与噻唑环碳 C5 的 C-H⋯O 弱氢键。除此之外,酰胺氮原子 N23 与硫原子 S8 形成分子内 N-H⋯S 氢键,对稳定侧链构象具有重要作用;还有多组 C-H⋯O 弱氢键分布于分子之间,作用对象包括电离的羧基氧与羰基氧,共同构成三维氢键网络。分子间相互作用以静电吸引为主,其中既包括阳离子配位作用,也涵盖氢键的静电贡献;分子内变形能则以键角畸变为主,扭转项也占显著比例,这与稠合 β- 内酰胺环体系的刚性结构特征相符。

分子构象与堆积

氯唑西林钠一水合物的晶态分子构象接近能量局域最小值。晶态下的分子构象能量仅比孤立分子的局域最低能量构象高 4.1 kcal/mol,二者能量差仅为 0.7 kcal/mol,差异主要来自 β- 内酰胺环体系相对于分子其余部分的取向,说明晶体堆积作用对分子构象的扰动很小。与氟代衍生物结构(BEBCAM)对比发现,二者晶格参数高度相似,晶体结构模式接近,反映了卤素取代对青霉素钠盐晶体架构的影响较小。分子占据体积为 546.06 ų,占单位晶胞四分之一体积的 97.97%,堆积并不紧密,每个非氢原子对应体积为 17.4 ų;所有显著的近距离接触均与氢键相关。该晶体倾向于呈现片状形貌,{002} 晶面为主要显露面[1]。

沿a轴观察的克洛沙星钠一水合物的晶体结构.png

图二 沿a轴观察的克洛沙星钠一水合物的晶体结构

参考文献

[1]James A. Kaduk , Amy M. Gindhart,  Thomas N. Blanton. Crystal structure of cloxacillin sodium monohydrate,C19H17ClN3O5SNa(H2O). [J]. Powder Diffraction, 2019, 34(4):374-378.

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