木瓜蛋白酶是存在于番木瓜果实中的一种半胱氨酸蛋白酶。其对于嫩化肉类起着重要作用，市面上更多称为松肉粉或嫩肉粉。
催化机制
木瓜蛋白酶的剪切肽键的机制包括：在His-159作用下Cys-25去质子化，而Asn-158能够帮助His-159的咪唑环的摆放，使得去质子化可以发生；然后Cys-25亲核攻击肽主链上的羰基碳，并与之共价连接形成酰基－酶中间体；接着酶与一个水分子作用，发生去酰基化，并释放肽链的羰基末端。
功效与作用
木瓜蛋白酶是一种有用的消化酶，能帮助胃更好的分解蛋白质，并促进营养吸收。例如，它对消化不良的人很有帮助；
它有溶解脂肪和软化皮肤作用。此外，它还帮助清除死亡细胞并保持皮肤健康。这也是这种酶广泛用于美容产品的原因所在；
它有抗炎作用，能抚慰肠胃并减轻水肿。木瓜蛋白酶的抗炎特性还能治疗烧伤和唇疱疹；
木瓜蛋白酶能有效治疗胃溃疡，溶解白喉薄膜；
木瓜蛋白酶的用途还包括治疗肿胀和擦伤，并能抑制手术后的肿胀和发烧。
用途
由于木瓜蛋白酶具有酶活高、热稳定性好、天然卫生安全及使用简便等特点，可广泛应用于食品、医药、日化、饲料、皮革及纺织等行业。
危害
木瓜蛋白酶可能引起超敏反应，如血压过低、心动过速。因此，对木瓜蛋白酶过敏者，禁止服用。
提取方法
一种高纯度木瓜蛋白酶的提取方法，将番木瓜的果实及乳汁充分利用，快速分离出粗酶，提高酶活回收率，并利用双水相萃取技术提高酶的纯度，为此在粗酶提取过程中使用Sephadex G100凝胶层析，进行粗酶的分离，此种方法可省去反复沉淀的步骤，使活力回收大大提高。精酶提取过程中使用双水相萃取，提纯精酶，此操作具有目标产物有较高的收率，不存在有机溶剂残留，分离过程经济，对木瓜蛋白酶的活性影响最小，所得到的木瓜蛋白酶产品活性高，酶回收率高，纯度高。1
参考文献
[1]羌利民. 一种高纯度木瓜蛋白酶的提取方法.CN101560508